Den animerede serie, som er baseret på succesfilmene, følger de to brødre Stuart og Georges eskapader. Stuart er godt nok kun 7½ cm høj, men hans lille krop rummer en modig, frygtløs og nysgerrig fyr, som aldrig afslår en udfordring. Selvom Stuarts "storebror" George er en dreng, som er både større og ældre, så er han en temmelig usikker lille dreng, da Stuart flytter ind hos familien Little. Men Stuart har haft en stor indflydelse på George og har opmuntret ham til at give sig i kast med udfordringer og komme med på spændende eventyr. Vores musehelt ser verden fra sin helt egen synsvinkel, mens han og hans "storebror" har masser af sjov sammen og lærer af et par fejltagelser undervejs.