Mesteren Jammerhead
Jammerhead bryder ud af fængsel, og vil gøre hans regnskab op med Turtles. Med hjælp fra en nyudviklet chip, kan Jammerhead downloade nye kampprogrammer, og lærer dem med det samme. Nu skal Turtles finde ud af hvordan de bekæmper den nye forbedret Jammerhead...

Svipturen
Torbin Ziixx får Turtles til at hjælpe ham med, at smugle et skib fuldt af nødhjælp, forbi Triceraton Gangsterne. Triceraton er fastbesluttet på at finde Ziixx, og det er op til Turtles at hjælpe ham med at flygte, og fuldføre hans mission...

Darius Duns Fald
Da Cody afslører Darius Duns hemmelige våbenprogram, vil Cody og hans onkel have den endelige kamp om hvem der har den ultimative kontrol over O’Neil Tech.